第5章 导师的惊讶，有望发表顶级期刊

    学霸，从生物黑科技开始 作者:佚名
    第5章 导师的惊讶，有望发表顶级期刊
    针对k-mer算法是一种识別病原体基因组的算法基础工具。
    属於基因重组中的重要技术。
    基本上每一个涉及到基因重组的人员都会涉及其运用。
    本科学生掌握工具的使用不难，但理解深层逻辑还有一定难度，更別提改良这种算法工具。
    李涧的论文可以优化基因序列比对算法，提高病原体基因组的识別效率，加快基因组的数据分析速度，並作出详细注释。
    大大缩短生物实验的前期准备时间。
    这种算法类的论文，不需要太多的数据支持，可以不用进行太多的实验，取一部分先前两个月时间內做过的实验数据，就能够满足论文的数据支持。
    最重要的还是涉及到数学以及编程算法方面的编写，这对於一个前世已经非常成熟的工具来说，非常的简单。
    只需要將蓝星的工具稍微削减一部分的功能之后，编写出来即可。
    涉及到的数学、计算机学的知识都不是很难。
    李涧有了思路之后，很快沉浸在了论文的编写过程之中。
    通过对蓝星的工具进行解析，获取了许多先进的理念，对自身现有的学识不足，有了更深层次的了解。
    特別是在数学计算以及计算机编程方面，还有很大的缺陷。
    核心代码放在面前，都搞不懂其中所代表的意义。
    “这是你写的论文，怎么会想到这个方向？虽然跟生物信息学有一定关联性，但更偏向於基因重组的方向。”
    忽然，一个熟悉的声音从身后响起。
    李涧转头看过去，发现导师周靖学教授已经站在了自己的身后，不知道有多久的时间。
    “对，老师……我最近的实验已经完成了，所以就打算根据实验获取的数据，写一篇论文，看看能不能投稿出去。”
    李涧回答道。
    他们现在还是大三下学期的学生，没有確定毕业论文题目。
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    不过学校有一个规定，凡是投稿国內顶级期刊的论文或者各类竞赛获奖的论文都能够作为毕业论文进行毕业答辩。
    目前生物系专业的学科大学生竞赛已经报名截止，就算可以保命，前身是一个学渣，在系里也找不到队友，没办法参赛。
    剩下的路只有学术期刊投稿了。
    “你对基因重组技术很熟悉吗？”
    周靖学询问道。
    以本科阶段的基因重组知识积累，暂时还做不到这种程度。
    他很早就到了实验室里面，原本只是为了拿一样生物材料，但看见李涧在认真的写论文，忍不住凑过去看了几眼。
    这一看就被吸引住了。
    没想到自己这个刚刚招收的大三学生，竟然试图改进病原微生物的基因组鑑定方法。
    每一种全新的分析方法构建，都需要非常庞大的计算资源，以及长期大量的临床检验场景的数据支持。
    属於一种繁琐又精细的科研项目。
    原本打算斥责一番。
    但隨著对方写论文的逐渐呈现出来，他竟然感觉到了一丝醍醐灌顶的错觉。
    这学生改进的算法从思路上看，並没有什么大问题。
    甚至连模擬数据都跑出来了……
    “嗯，老师，我最近做的基因重组实验，正好运用到较多的blast，这种工具分析基因数据太过繁琐了，大部分的实验都用在了基因组的解析上面。”
    “所以我就有了一种想法，改进一下blast工具，创造一种更高效的分析工具。”
    李涧回答道，这是他早就想好的说法。
    不过为了堵住这个说法之中的漏洞，他最近需要好好的恶补一下数学跟编程方面的知识。
    “模擬数据看上去倒是没有多大的问题，充当毕业论文足够了，但那可就太可惜了。”
    “如果补全临床数据，彻底的验证你论文模擬数据之中的结论正確可行的话，足以发表一篇顶刊。
    你加我一下微信，回头我將隔壁医学院的同学推给你，你自己联繫一下，沟通临床研究的事情！”
    周靖学拿出手机，打开了微信扫一扫递了过来。
    李涧迅速的拿出手机打开了微信，加上了好友。
    “过程中遇到什么问题都可以来找我，或者找程颐，他是我手底下的博士生，算是你们的大师兄。”
    “不错，好好努力，论文写好了，我可以帮你看看。”
    周靖学听到了微信好友通过的提示音后，拍了拍李涧的肩膀，笑著说道，一改平常冷脸待人的模样，变得十分的宽和。
    原本不打算带本科生了，但是学校那边已经安排下来，他也没有拒绝。
    没想到竟然遇到一个不错的苗子。
    根据李涧所写的模擬数据来看，论文所改进的算法完全具备可行性。
    从他对这份数据的处理来看，在基因重组方面的知识比一些硕士研究生都要深入一些。
    现有的blast生物大分子对比工具是大洋对面的世界第一大国国家生物技术信息中心研究出来的顶尖工具，目前市场上主流的生物大分子比对工具。
    国內也有，但是相比blast的功能方面还差了一些，还有很长的路要要追赶。
    在临床治疗中分析病原微生物的工具，如果仅仅是已知的核酸测序的数据分析的话，大约十来分钟就能够搞定。
    確定好病原体就能够对症下药。
    但是如果是陌生未知的病原体，需要进行完整的基因库建库最少需要十多个小时。
    其中涉及到测序、数据標准化注释、功能性验证、临床关联性分析、数据入库等等工序，非常的复杂。
    难一点的病原体甚至需要数天乃至上月的时间进行测序建库工作。
    比如前些年刚刚发现的病毒，就花费了好几天的时间才確定完整的基因库。
    李涧的论文初稿之中提出的全新算法，就能够將临床之中的病原体检测时间压缩至两个小时……这就有一点过於先进了。
    足足压缩了数倍的时间，可以改变无数人的人生。
    拯救许多生命。
    这是万家生佛的一种创新。
    虽然周靖学不太相信李涧的论文能够成功完成。
    但有想法是好事，值得鼓励。
    只要去做，总会有收穫。
    哪怕是错误的结果，论文写不出来，也能够给以后的实验提供一些宝贵的经验。
    周靖学在实验方面非常的苛刻，但是並不会阻碍学生们自发的扩展实验，甚至还会免费给他们提供实验材料，帮忙分析数据。
    李涧这孩子虽然才大三，平时成绩基础差了一点，却没想到能够给他这么一个惊喜。
    原本因为在教务处看见李涧的成绩所带来的偏见，在此刻全部变成了惊喜。
    “我知道了，老师，那我本科论文题目……。”
    李涧听到老师的提示，心中一惊。
    这种简单的论文，都能够上一期顶级期刊吗？就算是国內的期刊，也非常了不得。
    可以给接下来的研究生面试提供极大的帮助。
    他只是想水一篇毕业论文而已，为接下来的考研爭取一些宽鬆的学习时间。
    没想到还能够发布到顶级期刊上。
    算是一个意外之喜。
    现在看来，还是高估这个世界的生物研究水平了。